Kuigi mikrokiudkangastel on palju eeliseid, on neil ka mõned puudused:
Mõju keskkonnale: Mikrokiudkangad on valmistatud sünteetilistest materjalidest, tavaliselt polüestrist ja polüamiidist (nailon), mis on saadud naftast. Selle tulemusena ei ole mikrokiudkangad biolagunevad ja võivad ebaõige kõrvaldamise korral põhjustada keskkonnareostust.
Mikroplasti reostus: kui mikrokiudkangast pestakse, võivad väikesed mikrokiud kangast välja eralduda ja sattuda veekogudesse, soodustades mikroplasti reostust ookeanides ja veekogudes. Neid mikrokiude võivad veeorganismid alla neelata ja neil on negatiivne mõju mereelustikule ja ökosüsteemidele.
Vastupidavus: kuigi mikrokiudkangad on üldiselt vastupidavad ja kauakestvad, võivad need aja jooksul tõmbuda või kinni jääda, eriti kui neid pestakse või kuivatatakse kõrgel temperatuuril või kareda kangaga.
Staatiline elekter: mikrokiudkangad võivad tekitada staatilist elektrit, mis võib põhjustada kiudude ja tolmu kleepumist kangale. See võib olla eriti märgatav teatud pindade või esemete puhastamisel.
Tundlikkus kuumuse suhtes: mikrokiudkangad võivad olla kuumuse suhtes tundlikud ja kõrge temperatuur võib kahjustada või sulatada sünteetilisi kiude. Kahjustuste vältimiseks on oluline järgida tootja soovitusi mikrokiudkangaste pesemisel ja kuivatamisel.
Piiratud imamisvõime teatud vedelike puhul: kuigi mikrokiud absorbeerib hästi vett ja muid vedelikke, ei pruugi see olla nii tõhus õlipõhiste ainete või rasvaste lekete imamisel.
Võimalik määrdumine: mõned mikrokiudkangad võivad olla altid määrdumisele, eriti kui need puutuvad kokku teatud ainetega, nagu õlid või värvained.
Üldiselt, kuigi mikrokiudkangad pakuvad puhastamiseks ja muudeks rakendusteks palju eeliseid, on oluline olla teadlik nendest võimalikest puudustest ja võtta meetmeid nende mõju leevendamiseks, näiteks mikrokiudtoodete nõuetekohane kõrvaldamine ja mikrokiu eraldumise minimeerimine pesemise ajal.
